Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trmt112Q9DCG9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms