Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms