Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms