Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms