Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms