Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcc1Q9D4H2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcc1Q9D4H2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcc1Q9D4H2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcc1Q9D4H2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gcc1Q9D4H2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gcc1Q9D4H2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms