Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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