Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ube2cQ9D1C1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Ube2cQ9D1C1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms