Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms