Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ChtopQ9CY57 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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