Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxxc1Q9CWW7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms