Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms