Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms