Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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