Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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