Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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