Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT2

Rbm7, RNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm7Q9CQT2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rbm7Q9CQT2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms