Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl20Q9CQL4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl20Q9CQL4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl20Q9CQL4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl20Q9CQL4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl20Q9CQL4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl20Q9CQL4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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