Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms