Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms