Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5aQ9CQD1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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