Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med4Q9CQA5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms