Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt23Q99PS0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt23Q99PS0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms