Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac9Q99N13 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdac9Q99N13 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hdac9Q99N13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac9Q99N13 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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