Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms