Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms