Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms