Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm43Q99J64 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm43Q99J64 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms