Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tspan1Q99J59 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms