Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctu1Q99J10 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms