Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms