Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc4Q924T3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc4Q924T3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Xrcc4Q924T3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc4Q924T3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Xrcc4Q924T3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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