Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms