Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smc1bQ920F6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smc1bQ920F6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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