Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms