Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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