Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps3Q91VB4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps3Q91VB4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hps3Q91VB4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hps3Q91VB4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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