Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a20aQ8VDB9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms