Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt25Q8VCW2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms