Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Dnajc28Q8VCE1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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