Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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