Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OptnQ8K3K8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms