Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trappc12Q8K2L8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms