Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms