Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edc3Q8K2D3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc3Q8K2D3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc3Q8K2D3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc3Q8K2D3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edc3Q8K2D3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms