Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cd300eQ8K249 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cd300eQ8K249 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cd300eQ8K249 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cd300eQ8K249 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms