Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pms1Q8K119 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Pms1Q8K119 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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