Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI43

Myl6b, Myosin light chain 6B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl6bQ8CI43 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myl6bQ8CI43 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myl6bQ8CI43 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms