Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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