Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms